MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU02

Total Repeats: 2024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009974	CAC	2	6	46	51	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009974	T	6	6	100	105	0 %	100 %	0 %	0 %	159901743
3	NC_009974	GGTCGT	2	12	128	139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159901743
4	NC_009974	CG	3	6	140	145	0 %	0 %	50 %	50 %	159901743
5	NC_009974	TCT	2	6	160	165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901743
6	NC_009974	CGCAA	2	10	204	213	40 %	0 %	20 %	40 %	159901743
7	NC_009974	CCA	2	6	234	239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901743
8	NC_009974	CGT	2	6	251	256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901743
9	NC_009974	CGC	2	6	270	275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901743
10	NC_009974	CCG	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901743
11	NC_009974	TCT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901743
12	NC_009974	GGC	2	6	394	399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
13	NC_009974	GAC	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901743
14	NC_009974	CAC	2	6	473	478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901743
15	NC_009974	CAC	2	6	518	523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901743
16	NC_009974	TGATC	2	10	526	535	20 %	40 %	20 %	20 %	159901743
17	NC_009974	GGC	2	6	614	619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
18	NC_009974	CGG	2	6	637	642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
19	NC_009974	GAG	2	6	660	665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901743
20	NC_009974	TCA	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901743
21	NC_009974	GCCAAG	2	12	720	731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901743
22	NC_009974	CCCAC	2	10	770	779	20 %	0 %	0 %	80 %	159901743
23	NC_009974	CCG	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901743
24	NC_009974	CAA	2	6	836	841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901743
25	NC_009974	GGCGG	2	10	878	887	0 %	0 %	80 %	20 %	159901743
26	NC_009974	GCG	2	6	932	937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901743
27	NC_009974	CGT	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
28	NC_009974	TCC	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
29	NC_009974	CGG	2	6	1091	1096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
30	NC_009974	GTC	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
31	NC_009974	GTG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901744
32	NC_009974	CAT	2	6	1113	1118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
33	NC_009974	TCC	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
34	NC_009974	CGG	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
35	NC_009974	CAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
36	NC_009974	CCT	3	9	1358	1366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
37	NC_009974	TTGC	2	8	1395	1402	0 %	50 %	25 %	25 %	159901744
38	NC_009974	TCG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
39	NC_009974	TCA	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
40	NC_009974	TTC	2	6	1458	1463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
41	NC_009974	CAA	2	6	1502	1507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901744
42	NC_009974	TCG	2	6	1633	1638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
43	NC_009974	GCG	2	6	1653	1658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
44	NC_009974	AGT	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901744
45	NC_009974	TCC	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901744
46	NC_009974	GGC	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901744
47	NC_009974	GCCA	2	8	1787	1794	25 %	0 %	25 %	50 %	159901744
48	NC_009974	CCG	2	6	1797	1802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901744
49	NC_009974	CGCTG	2	10	1860	1869	0 %	20 %	40 %	40 %	159901744
50	NC_009974	GTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901744
51	NC_009974	TTC	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
52	NC_009974	TTC	2	6	1950	1955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
53	NC_009974	CTT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901744
54	NC_009974	CATCA	2	10	2154	2163	40 %	20 %	0 %	40 %	159901744
55	NC_009974	TGA	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901744
56	NC_009974	AGC	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901744
57	NC_009974	AT	3	6	2332	2337	50 %	50 %	0 %	0 %	159901744
58	NC_009974	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901744
59	NC_009974	CGC	2	6	2445	2450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901744
60	NC_009974	CGT	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
61	NC_009974	TTG	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901744
62	NC_009974	CCA	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901744
63	NC_009974	TGG	2	6	2779	2784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901744
64	NC_009974	CAC	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901744
65	NC_009974	CAT	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901744
66	NC_009974	CGC	2	6	2879	2884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901744
67	NC_009974	GCT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901744
68	NC_009974	GGT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901744
69	NC_009974	TCC	2	6	2933	2938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009974	CAG	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009974	TG	3	6	3038	3043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009974	CCAT	2	8	3094	3101	25 %	25 %	0 %	50 %	159901745
73	NC_009974	CTG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901745
74	NC_009974	TGA	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901745
75	NC_009974	GGGCA	2	10	3215	3224	20 %	0 %	60 %	20 %	159901745
76	NC_009974	CCAC	3	12	3244	3255	25 %	0 %	0 %	75 %	159901745
77	NC_009974	TCA	3	9	3297	3305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901745
78	NC_009974	GCT	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901745
79	NC_009974	GAC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901745
80	NC_009974	TGGT	2	8	3485	3492	0 %	50 %	50 %	0 %	159901745
81	NC_009974	CCG	2	6	3517	3522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901745
82	NC_009974	ATG	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901745
83	NC_009974	CAC	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901745
84	NC_009974	GCT	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901745
85	NC_009974	CCT	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009974	ACG	2	6	3630	3635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009974	ATCA	2	8	3636	3643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009974	TGC	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009974	GCA	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009974	TCG	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009974	GCT	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009974	GTC	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009974	AGC	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901746
94	NC_009974	GTCG	2	8	3832	3839	0 %	25 %	50 %	25 %	159901746
95	NC_009974	CAG	2	6	3943	3948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901746
96	NC_009974	TTGCG	2	10	4114	4123	0 %	40 %	40 %	20 %	159901746
97	NC_009974	CAA	2	6	4269	4274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901746
98	NC_009974	TGGGGG	2	12	4339	4350	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	159901746
99	NC_009974	TGG	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009974	CGAA	2	8	4418	4425	50 %	0 %	25 %	25 %	159901747
101	NC_009974	GCG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901747
102	NC_009974	CCAT	2	8	4462	4469	25 %	25 %	0 %	50 %	159901747
103	NC_009974	TGG	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901747
104	NC_009974	GCA	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901747
105	NC_009974	CG	3	6	4579	4584	0 %	0 %	50 %	50 %	159901747
106	NC_009974	GCC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901747
107	NC_009974	ACC	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901747
108	NC_009974	CCG	2	6	4779	4784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901747
109	NC_009974	GCC	2	6	4805	4810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901747
110	NC_009974	CCA	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901747
111	NC_009974	CGGCG	2	10	4841	4850	0 %	0 %	60 %	40 %	159901747
112	NC_009974	GCGT	2	8	4867	4874	0 %	25 %	50 %	25 %	159901747
113	NC_009974	CCA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901747
114	NC_009974	CCT	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009974	ATCA	2	8	4959	4966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009974	TGC	2	6	4967	4972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009974	AAC	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901748
118	NC_009974	AATG	2	8	5131	5138	50 %	25 %	25 %	0 %	159901748
119	NC_009974	AAC	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901748
120	NC_009974	CGC	3	9	5197	5205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901748
121	NC_009974	ACT	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901748
122	NC_009974	GGT	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901748
123	NC_009974	GCCC	2	8	5386	5393	0 %	0 %	25 %	75 %	159901748
124	NC_009974	TCG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901748
125	NC_009974	CGC	2	6	5443	5448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901748
126	NC_009974	TGC	3	9	5514	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901748
127	NC_009974	ACC	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901748
128	NC_009974	TCAC	2	8	5585	5592	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009974	CGTC	2	8	5593	5600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009974	CGC	2	6	5610	5615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009974	CGG	2	6	5641	5646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009974	TCA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009974	ACC	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901749
134	NC_009974	CACC	2	8	5854	5861	25 %	0 %	0 %	75 %	159901749
135	NC_009974	CAT	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901749
136	NC_009974	ATC	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901749
137	NC_009974	ATC	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901749
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153	NC_009974	CTT	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901750
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250	NC_009974	TGAT	2	8	11061	11068	25 %	50 %	25 %	0 %	159901752
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253	NC_009974	GTT	2	6	11165	11170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_009974	TGG	2	6	11215	11220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_009974	ACT	2	6	11237	11242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_009974	ACC	3	9	11262	11270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_009974	GGT	2	6	11305	11310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009974	CGT	2	6	11336	11341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_009974	CTG	2	6	11454	11459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_009974	CAT	2	6	11478	11483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_009974	G	6	6	11488	11493	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
262	NC_009974	TCGCTC	2	12	11520	11531	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
263	NC_009974	GAT	2	6	11569	11574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009974	GGC	2	6	11599	11604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_009974	CGAAC	2	10	11624	11633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
266	NC_009974	GTC	2	6	11664	11669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_009974	ACA	2	6	11683	11688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_009974	CG	3	6	11722	11727	0 %	0 %	50 %	50 %	159901753
269	NC_009974	CAA	2	6	11881	11886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901753
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277	NC_009974	CCAAC	2	10	12127	12136	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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500	NC_009974	A	7	7	22271	22277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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